Bibliography

1

D. J. Wales, Energy Landscapes, Cambridge University Press, Cambridge (2003).

2

A. D. MacKerell, D. Bashford, M. Bellott, R. L. Dunbrack, J. D. Evanseck, M. J. Field, S. Fischer, J. Gao, H. Guo, S. Ha, D. JosephMcCarthy, L. Kuchnir, K. Kuczera, F. T. K. Lau, C. Mattos, S. Michnick, T. Ngo, D. T. Nguyen, B. Prodhom, W. E. Reiher, B. Roux, M. Schlenkrich, J. C. Smith, R. Stote, J. Straub, M. Watanabe, J. WiorkiewiczKuczera, D. Yin and M. Karplus, J. Phys. Chem. B 102, 3586 (1998).

3

T. Lazaridis and M. Karplus, Proteins: Struct., Func. and Gen. 35, 133 (1999).

4

W. D. Cornell, P. Cieplak, C. I. Bayly, I. R. Gould, K. M. Merz, D. M. Ferguson, D. C. Spellmeyer, T. Fox, J. W. Caldwell and P. A. Kellman, J. Am. Chem. Soc. 117, 5179 (1995).

5

J. Pancír, Collect. Czech. Chem. Commun. 40, 1112 (1974).

6

C. J. Cerjan and W. H. Miller, J. Chem. Phys. 75, 2800 (1981).

7

J. Simons, P. Jorgensen, H. Taylor and J. Ozment, J. Phys. Chem. 87, 2745 (1983).

8

D. O'Neal, H. Taylor and J. Simons, J. Phys. Chem. 88, 1510 (1984).

9

A. Banerjee, N. Adams, J. Simons and R. Shepard, J. Phys. Chem. 89, 52 (1985).

10

J. Baker, J. Comp. Chem. 7, 385 (1986).

11

J. Baker, J. Comp. Chem. 8, 563 (1987).

12

A. J. Stone, Chem. Phys. Lett. 83, 233 (1981).

13

A. J. Stone and M. Alderton, Mol. Phys. 56, 1047 (1985).

14

S. A. Trygubenko and D. J. Wales, J. Chem. Phys. 120, 2082 (2004).

15

W. E, W. Ren and E. Vanden-Eijnden, Phys. Rev. B 66, 052301 (2002).

16

B. Peters, A. Heyden, A. T. Bell and A. Chakraborty, J. Chem. Phys. 120, 7877 (2004).

17

D. J. Wales, Phil. Trans. Roy. Soc. A 363, 357 (2005).

18

J. M. Sorenson and T. Head-Gordon, J. Computational Biology 7, 469 (2000).

19

S. Brown, N. J. Fawzi and T. Head-Gordon, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 10712 (2003).

20

T. R. Walsh and D. J. Wales, J. Chem. Phys. 109, 6691 (1998).

21

J. M. Carr, S. A. Trygubenko and D. J. Wales, J. Chem. Phys. 122, 234903 (2005).

22

M. J. D. Powell, Math. Prog. 1, 26 (1971).

23

K. Németh, O. Coulaud, G. Monard and J. G. Angyan, J. Chem. Phys. 113, 5598 (2000).

24

G. Henkelman and H. Jónsson, J. Chem. Phys. 113, 9978 (2000).

25

G. Henkelman, B. P. Uberuaga and H. Jónsson, J. Chem. Phys. 113, 9901 (2000).

26

A. P. Sutton and J. Chen, Phil. Mag. Lett. 61, 139 (1990).

27

D. J. Wales, Chem. Phys. Lett. 166, 419 (1990).

28

J. P. K. Doye and D. J. Wales, J. Chem. Soc., Faraday Trans. 88, 3295 (1992).

29

D. J. Wales and A. M. Lee, Phys. Rev. A 47, 380 (1993).

30

L. A. Girifalco, J. Phys. Chem. 96, 858 (1992).

31

R. D. Amos, I. L. Alberts, J. S. Andrews, S. M. Colwell, N. C. Handy, D. Jayatilaka, P. J. Knowles, R. Kobayashi, K. E. Laidig, G. Laming, A. M. Lee, P. E. Maslen, C. W. Murray, J. E. Rice, E. D. Simandiras, A. J. Stone, M.-D. Su and D. J. Tozer, The Cambridge Analytic Derivatives Package Issue 6, Cambridge (1995).

32

S. P. Balm, A. W. Allaf, H. W. Kroto and J. N. Murrell, J. Chem. Soc., Faraday Trans 87, 803 (1991).

33

M. Dzugutov, Phys. Rev. A 46, R2984 (1992).

34

M. Dzugutov, J. Non-Cryst. Solids 156-158, 173 (1993).

35

M. B. Hall and R. F. Fenske, Inorg. Chem. 11, 768 (1972).

36

Y. Ueda, H. Taketomi and N. Go, Biopolymers 17, 1531 (1978).

37

J. N. Murrell and R. E. Mottram, Mol. Phys. 69, 571 (1990).

38

J. N. Murrell and J. A. Rodriguez-Ruiz, Mol. Phys. 71, 823 (1990).

39

A. R. Alderzi, R. L. Johnston, J. N. Murrell and J. A. Rodrigez-Ruiz, Mol. Phys. 73, 265 (1991).

40

B. E. Eggen, R. L. Johnston, S. Li and J. N. Murrell, Mol. Phys. 76, 1405 (1992).

41

J.-Y. Feng, R. L. Johnston and J. N. Murrell, Mol. Phys. 78, 1405 (1993).

42

M. Allen and D. J. Tildesley, Computer simulation of liquids, Clarendon Press, Oxford (1987).

43

E. A. Mason and H. W. Schamp, Ann. Phys. (USA) 4, 233 (1958).

44

S. Sastry, P. G. Debenedetti and F. H. Stillinger, Nature 393, 554 (1998).

45

P. A. Braier, R. S. Berry and D. J. Wales, J. Chem. Phys. 93, 8745 (1990).

46

J. M. Pacheco and J. P. P. Ramalho, Phys. Rev. Lett. 79, 3873 (1997).

47

S. Li, R. L. Johnston and J. N. Murrell, J. Chem. Soc., Faraday Trans. 88, 1229 (1992).

48

F. H. Stillinger and T. A. Weber, Phys. Rev. B 31, 5262 (1985).

49

M. P. Tosi and F. G. Fumi, J. Phys. Chem. Solids 25, 45 (1964).

50

D. O. Welch, O. W. Lazareth and G. J. Diens, J. Chem. Phys. 94, 835 (1976).

51

N. G. Phillips, C. W. S. Conover and L. A. Bloomfield, J. Chem. Phys. 94, 4980 (1991).

52

W. L. Jorgensen, J. Am. Chem. Soc. 103, 335 (1981).

53

J. P. K. Doye, D. J. Wales, F. H. M. Zetterling and M. Dzugutov, J. Chem. Phys. 118, 2792 (2003).

54

D. J. Wales, J. Chem. Phys. 101, 3750 (1994).

55

M. Page and J. W. McIver, J. Chem. Phys. 88, 922 (1988).

56

L. J. Munro and D. J. Wales, Phys. Rev. B 59, 3969 (1999).

57

Y. Kumeda, L. J. Munro and D. J. Wales, Chem. Phys. Lett. 341, 185 (2001).

58

J. Baker and W. H. Hehre, J. Comp. Chem. 12, 606 (1991).

59

D. J. Wales, J. Chem. Soc., Faraday Trans. 89, 1305 (1993).

60

D. J. Wales and T. R. Walsh, J. Chem. Phys. 105, 6957 (1996).

61

A. Banerjee and N. P. Adams, Int. J. Quant. Chem. 43, 855 (1992).

62

D. J. Wales, Mol. Phys. 100, 3285 (2002).