Bibliography

1

D. J. Wales, Energy Landscapes, Cambridge University Press, Cambridge (2003).

2

A. D. MacKerell, D. Bashford, M. Bellott, R. L. Dunbrack, J. D. Evanseck, M. J. Field, S. Fischer, J. Gao, H. Guo, S. Ha, D. JosephMcCarthy, L. Kuchnir, K. Kuczera, F. T. K. Lau, C. Mattos, S. Michnick, T. Ngo, D. T. Nguyen, B. Prodhom, W. E. Reiher, B. Roux, M. Schlenkrich, J. C. Smith, R. Stote, J. Straub, M. Watanabe, J. WiorkiewiczKuczera, D. Yin and M. Karplus, J. Phys. Chem. B 102, 3586 (1998).

3

T. Lazaridis and M. Karplus, Proteins: Struct., Func. and Gen. 35, 133 (1999).

4

W. D. Cornell, P. Cieplak, C. I. Bayly, I. R. Gould, K. M. Merz, D. M. Ferguson, D. C. Spellmeyer, T. Fox, J. W. Caldwell and P. A. Kellman, J. Am. Chem. Soc. 117, 5179 (1995).

5

J. Pancír, Collect. Czech. Chem. Commun. 40, 1112 (1974).

6

C. J. Cerjan and W. H. Miller, J. Chem. Phys. 75, 2800 (1981).

7

J. Simons, P. Jorgensen, H. Taylor and J. Ozment, J. Phys. Chem. 87, 2745 (1983).

8

D. O'Neal, H. Taylor and J. Simons, J. Phys. Chem. 88, 1510 (1984).

9

A. Banerjee, N. Adams, J. Simons and R. Shepard, J. Phys. Chem. 89, 52 (1985).

10

J. Baker, J. Comp. Chem. 7, 385 (1986).

11

J. Baker, J. Comp. Chem. 8, 563 (1987).

12

J. Barzilai and J. M. Borwein, IMA J. Numer. Anal. 8, 141 (1988)).

13

M. Raydan, SIAM J. Optim. 7, 26 (1997).

14

D. J. Wales, Phil. Trans. Roy. Soc. A 363, 357 (2005).

15

D. Chakrabarti and D. Wales, Phys. Chem. Chem. Phys. 11, 1970 (2009).

16

A. J. Stone, Chem. Phys. Lett. 83, 233 (1981).

17

A. J. Stone and M. Alderton, Mol. Phys. 56, 1047 (1985).

18

S. A. Trygubenko and D. J. Wales, J. Chem. Phys. 120, 2082 (2004).

19

W. E, W. Ren and E. Vanden-Eijnden, Phys. Rev. B 66, 052301 (2002).

20

B. Peters, A. Heyden, A. T. Bell and A. Chakraborty, J. Chem. Phys. 120, 7877 (2004).

21

J. M. Sorenson and T. Head-Gordon, J. Computational Biology 7, 469 (2000).

22

S. Brown, N. J. Fawzi and T. Head-Gordon, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 10712 (2003).

23

J. Kim, T. Keyes and J. E. Straub, Physical Review E 79, 030902 (2009).

24

D. Chakrabarti, S. N. Fejer and D. J. Wales, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106, 20164 (2009).

25

T. R. Walsh and D. J. Wales, J. Chem. Phys. 109, 6691 (1998).

26

J. M. Carr, S. A. Trygubenko and D. J. Wales, J. Chem. Phys. 122, 234903 (2005).

27

M. J. D. Powell, Math. Prog. 1, 26 (1971).

28

K. Németh, O. Coulaud, G. Monard and J. G. Angyan, J. Chem. Phys. 113, 5598 (2000).

29

P. Pulay, G. Fogarasi, F. Pang and J. E. Boggs, J. Am. Chem. Soc. 101, 2550 (1979).

30

G. Fogorasi, X. Zhou, P. W. Taylor and P. Pulay, J. Am. Chem. Soc. 114, 8191 (1992).

31

G. Henkelman and H. Jónsson, J. Chem. Phys. 113, 9978 (2000).

32

G. Henkelman, B. P. Uberuaga and H. Jónsson, J. Chem. Phys. 113, 9901 (2000).

33

T. S. Totton, A. J. Misquitta and M. Kraft, J. Chem. Theory Comput. 6, 683 (2010).

34

L. Paramonov and S. N. Yaliraki, J. Chem. Phys. 123, 194111 (2005).

35

J. O. Richardson and S. C. Althorpe, J. Chem. Phys. 134, 054109 (2011).

36

J. B. Rommel and J. Kästner, J. Chem. Phys. 134, 184107 (2011).

37

A. P. Sutton and J. Chen, Phil. Mag. Lett. 61, 139 (1990).

38

D. J. Wales, Chem. Phys. Lett. 166, 419 (1990).

39

J. P. K. Doye and D. J. Wales, J. Chem. Soc., Faraday Trans. 88, 3295 (1992).

40

D. J. Wales and A. M. Lee, Phys. Rev. A 47, 380 (1993).

41

L. A. Girifalco, J. Phys. Chem. 96, 858 (1992).

42

R. D. Amos, I. L. Alberts, J. S. Andrews, S. M. Colwell, N. C. Handy, D. Jayatilaka, P. J. Knowles, R. Kobayashi, K. E. Laidig, G. Laming, A. M. Lee, P. E. Maslen, C. W. Murray, J. E. Rice, E. D. Simandiras, A. J. Stone, M.-D. Su and D. J. Tozer, The Cambridge Analytic Derivatives Package Issue 6, Cambridge (1995).

43

S. P. Balm, A. W. Allaf, H. W. Kroto and J. N. Murrell, J. Chem. Soc., Faraday Trans 87, 803 (1991).

44

A. S. Christensen, T. Kubař, Q. Cui and M. Elstner, Chem. Rev. 116, 5301 (2016).

45

M. Dzugutov, Phys. Rev. A 46, R2984 (1992).

46

M. Dzugutov, J. Non-Cryst. Solids 156-158, 173 (1993).

47

M. B. Hall and R. F. Fenske, Inorg. Chem. 11, 768 (1972).

48

Y. Ueda, H. Taketomi and N. Gō, Biopolymers 17, 1531 (1978).

49

J. N. Murrell and R. E. Mottram, Mol. Phys. 69, 571 (1990).

50

J. N. Murrell and J. A. Rodriguez-Ruiz, Mol. Phys. 71, 823 (1990).

51

A. R. Alderzi, R. L. Johnston, J. N. Murrell and J. A. Rodrigez-Ruiz, Mol. Phys. 73, 265 (1991).

52

B. E. Eggen, R. L. Johnston, S. Li and J. N. Murrell, Mol. Phys. 76, 1405 (1992).

53

J.-Y. Feng, R. L. Johnston and J. N. Murrell, Mol. Phys. 78, 1405 (1993).

54

M. Allen and D. J. Tildesley, Computer simulation of liquids, Clarendon Press, Oxford (1987).

55

E. A. Mason and H. W. Schamp, Ann. Phys. (USA) 4, 233 (1958).

56

S. Sastry, P. G. Debenedetti and F. H. Stillinger, Nature 393, 554 (1998).

57

P. A. Braier, R. S. Berry and D. J. Wales, J. Chem. Phys. 93, 8745 (1990).

58

S. M. Foiles, M. I. Baskes and M. S. Daw, Phys. Rev. B 33, 7983 (1986).

59

M. S. Daw and M. I. Baskes, Phys. Rev. B 29, 6443 (1984).

60

T. N. Truong, D. G. Truhlar and B. C. Garrett, J. Phys. Chem. 93, 8227 (1989).

61

T. N. Truong and D. G. Truhlar, J. Phys. Chem. 94, 8262 (1990).

62

S. E. Wonchoba and D. G. Truhlar, Phys. Rev. B 51, 9985 (1995).

63

S. E. Wonchoba and D. G. Truhlar, Phys. Rev. B 53, 11222 (1996).

64

S. E. Wonchoba and D. G. Truhlar, J. Phys. Chem. B 102, 6842 (1998).

65

J. T. Kindt and J. C. Tully, J. Chem. Phys. 111, 11060 (1999).

66

J. M. Pacheco and J. P. P. Ramalho, Phys. Rev. Lett. 79, 3873 (1997).

67

S. Li, R. L. Johnston and J. N. Murrell, J. Chem. Soc., Faraday Trans. 88, 1229 (1992).

68

F. H. Stillinger and T. A. Weber, Phys. Rev. B 31, 5262 (1985).

69

M. P. Tosi and F. G. Fumi, J. Phys. Chem. Solids 25, 45 (1964).

70

D. O. Welch, O. W. Lazareth and G. J. Diens, J. Chem. Phys. 94, 835 (1976).

71

N. G. Phillips, C. W. S. Conover and L. A. Bloomfield, J. Chem. Phys. 94, 4980 (1991).

72

W. L. Jorgensen, J. Am. Chem. Soc. 103, 335 (1981).

73

C. Bannwarth, E. Caldeweyher, S. Ehlert, A. Hansen, P. Pracht, J. Seibert, S. Spicher and S. Grimme, WIREs Comput. Mol. Sci. p. e01493 (2020).

74

J. P. K. Doye, D. J. Wales, F. H. M. Zetterling and M. Dzugutov, J. Chem. Phys. 118, 2792 (2003).

75

D. J. Wales, J. Chem. Phys. 101, 3750 (1994).

76

M. Page and J. W. McIver, J. Chem. Phys. 88, 922 (1988).

77

L. J. Munro and D. J. Wales, Phys. Rev. B 59, 3969 (1999).

78

Y. Kumeda, L. J. Munro and D. J. Wales, Chem. Phys. Lett. 341, 185 (2001).

79

J. Baker and W. H. Hehre, J. Comp. Chem. 12, 606 (1991).

80

D. J. Wales, J. Chem. Soc., Faraday Trans. 89, 1305 (1993).

81

D. J. Wales and T. R. Walsh, J. Chem. Phys. 105, 6957 (1996).

82

A. Banerjee and N. P. Adams, Int. J. Quant. Chem. 43, 855 (1992).

83

D. J. Wales, Mol. Phys. 100, 3285 (2002).

84

J. Kästner, J. M. Carr, T. W. Keal, W. Thiel, A. Wander and P. Sherwood, J. Phys. Chem. A 113, 11856 (2009).

85

J. B. Rommel, Goumans, T. P. M. and J. Kästner, J. Chem. Theory Comput. 7, 690 (2011).

86

J. Meisner, J. B. Rommel and J. Kästner, J. Comput. Chem. 32, 3456 (2011).