hdiff output

r33773/GMIN.tex 2018-02-22 13:30:08.082889702 +0000 r33772/GMIN.tex 2018-02-22 13:30:08.326893124 +0000
  1: % <preamble>  1: % <preamble>
  2: \documentclass[12pt,a4paper,dvips]{article}  2: \documentclass[12pt,a4paper,dvips]{article}
  3: \usepackage{graphicx,xspace,overcite,amsmath}  3: \usepackage{graphicx,xspace,overcite,amsmath}
  4:   4: 
  5: \usepackage[dvips,  5: \usepackage[dvips,
  6:         bookmarks,  6:         bookmarks,
  7:         colorlinks=true,  7:         colorlinks=true,
  8:         hyperindex=true,  8:         hyperindex=true,
  9:         hyperfigures,  9:         hyperfigures,
 10:         bookmarksnumbered=true]{hyperref} 10:         bookmarksnumbered=true]{hyperref}
 11: \usepackage{float} 
 12:  11: 
 13: \def\mydash{${-}$} 12: \def\mydash{${-}$}
 14: \newcommand{\D}{\displaystyle} 13: \newcommand{\D}{\displaystyle}
 15: \newcommand{\etal}{{\it et al.}} 14: \newcommand{\etal}{{\it et al.}}
 16: \sloppy 15: \sloppy
 17:  16: 
 18: % </preamble> 17: % </preamble>
 19: % <document> 18: % <document>
 20: % <frontpage> 19: % <frontpage>
 21: \begin{document} 20: \begin{document}
1554: The groups then follow, each one introduced by a line with two integers $p$ and $s$1553: The groups then follow, each one introduced by a line with two integers $p$ and $s$
1555: that specify the number of permutable atoms in the primary group and the number of other sets1554: that specify the number of permutable atoms in the primary group and the number of other sets
1556: of permutable atoms associated with the primary set.1555: of permutable atoms associated with the primary set.
1557: $s$ may be zero.1556: $s$ may be zero.
1558: Each secondary set of permutable atoms has $p$ members.1557: Each secondary set of permutable atoms has $p$ members.
1559: The following line contains the indices of the $p$ permutable atoms 1558: The following line contains the indices of the $p$ permutable atoms 
1560: in the primary set and then1559: in the primary set and then
1561: the indices of the atoms in each of the $s$ secondary sets, one set at 1560: the indices of the atoms in each of the $s$ secondary sets, one set at 
1562: a time.1561: a time.
1563: 1562: 
1564: \begin{figure}[H]1563: \begin{figure}[hH]
1565: \centerline{\includegraphics[width=0.5\textwidth]{PHE.eps}}1564: \centerline{\includegraphics[width=0.5\textwidth]{PHE.eps}}
1566: \end{figure}1565: \end{figure}
1567: 1566: 
1568: For the phenylalanine example illustrated we must allow three other pairs of1567: For the phenylalanine example illustrated we must allow three other pairs of
1569: atoms to exchange if we swap 7 and 8. Hence a suitable {\tt perm.allow} entry is1568: atoms to exchange if we swap 7 and 8. Hence a suitable {\tt perm.allow} entry is
1570: {\obeylines1569: {\obeylines
1571: 11570: 1
1572: 1571: 
1573: 2 31572: 2 3
1574: 1573: 


legend
Lines Added 
Lines changed
 Lines Removed

hdiff - version: 2.1.0