hdiff output

r32087/PATHSAMPLE.tex 2017-03-13 23:30:11.262836258 +0000 r32086/PATHSAMPLE.tex 2017-03-13 23:30:12.198848753 +0000
446: Note that you will need file {\tt odata.tssearch} in the current446: Note that you will need file {\tt odata.tssearch} in the current
447: working directory if {\it n} is greater than one.447: working directory if {\it n} is greater than one.
448: The {\tt odata.tssearch} file needs to contain OPTIM {\it PATH} 448: The {\tt odata.tssearch} file needs to contain OPTIM {\it PATH} 
449: and {\it DUMPALLPATHS\/} directives449: and {\it DUMPALLPATHS\/} directives
450: so that a {\tt path.info} file is created.450: so that a {\tt path.info} file is created.
451: It is no longer necessary to supply a separate {\tt odata.path} file.451: It is no longer necessary to supply a separate {\tt odata.path} file.
452: This keyword results in calls to the original single-ended transition state452: This keyword results in calls to the original single-ended transition state
453: searching subroutine, which is not efficiently parallelised.453: searching subroutine, which is not efficiently parallelised.
454: The {\it NEWCONNECTIONS\/} keyword should probably be used instead.454: The {\it NEWCONNECTIONS\/} keyword should probably be used instead.
455: 455: 
456: \item {\it CONNECTPAIRS connectfile\/}: minima are chosen for connection attempts based 
457: on the pairs specified in file {\tt connectfile}, which must have two integers per line 
458: corresonding to the order in {\tt min.data}. 
459:  
460: \item{\it CONINT\/} specifies that terms for internal minimum distances456: \item{\it CONINT\/} specifies that terms for internal minimum distances
461: should be included in the energy and gradient for the auxiliary interpolation457: should be included in the energy and gradient for the auxiliary interpolation
462: potential when {\it INTCONSTRAINT\/} is specified.458: potential when {\it INTCONSTRAINT\/} is specified.
463: 459: 
464: \item {\it CONNECTREGION min1 min2 dist\/}: grows the stationary point database by running460: \item {\it CONNECTREGION min1 min2 dist\/}: grows the stationary point database by running
465: double-ended transition state searches between minima whose minimum separation is less then461: double-ended transition state searches between minima whose minimum separation is less then
466: {\it dist}. {\it min1} and {\it min2} specify the starting minima in the double loop over462: {\it dist}. {\it min1} and {\it min2} specify the starting minima in the double loop over
467: pairs, so that restarted runs need not consider pairs that have previously been searched.463: pairs, so that restarted runs need not consider pairs that have previously been searched.
468: Minima that already have a direct connection are ignored.464: Minima that already have a direct connection are ignored.
469: The maximum number of candidate pairs calculated per call to {\bf connectd.f90} is 10000.465: The maximum number of candidate pairs calculated per call to {\bf connectd.f90} is 10000.


legend
Lines Added 
Lines changed
 Lines Removed

hdiff - version: 2.1.0