hdiff output

r29413/OPTIM.tex 2015-11-17 23:34:31.873736846 +0000 r29412/OPTIM.tex 2015-11-17 23:34:32.093739796 +0000
1961: order O, H, H, O, H, H, etc.1961: order O, H, H, O, H, H, etc.
1962: 1962: 
1963: \item {\it QSPCFW\/}: flexible water potential from  Paesani {\it et al.}~[{\it J.~Chem.~Phys.\/},1963: \item {\it QSPCFW\/}: flexible water potential from  Paesani {\it et al.}~[{\it J.~Chem.~Phys.\/},
1964: {\bf 125}, 184507 (2006)] coded by Dr Javier Hern\'andez-Rojas.1964: {\bf 125}, 184507 (2006)] coded by Dr Javier Hern\'andez-Rojas.
1965: The units of length and energy are \AA\ and kcal/mol. The atoms must be entered in the1965: The units of length and energy are \AA\ and kcal/mol. The atoms must be entered in the
1966: order O, H, H, O, H, H, etc.1966: order O, H, H, O, H, H, etc.
1967: 1967: 
1968: \item {\it RADIUS x\/}: specifies that atoms should not be allowed to move beyond a 1968: \item {\it RADIUS x\/}: specifies that atoms should not be allowed to move beyond a 
1969: distance {\it x\/} from the origin.1969: distance {\it x\/} from the origin.
1970: 1970: 
1971: \item {\it RANROT n\/}: for use with {\it PERMDIST\/}. Specifies 
1972: that {\it n\/} random orientations will be tried as well as the 
1973: initial standard alignment in {\tt minpermdist.f90}. Several hundred 
1974: random orientations may be needed to find the best translational/rotational/permutational 
1975: alignment of end points. 
1976:  
1977: \item {\it RANSEED n\/}: specifies the initial seed for random number generation, as used in 1971: \item {\it RANSEED n\/}: specifies the initial seed for random number generation, as used in 
1978: hard sphere moves with {\it FIXD}.1972: hard sphere moves with {\it FIXD}.
1979: 1973: 
1980: \item {\it RATIOS\/}: specifies that the pathway parameters needed to calculate catastrophe1974: \item {\it RATIOS\/}: specifies that the pathway parameters needed to calculate catastrophe
1981: ratios should be printed in a {\it PATH\/} run.1975: ratios should be printed in a {\it PATH\/} run.
1982: 1976: 
1983: \item {\it RBSYM\/}: specifies that internal symmetry operations permuting equivalent sites for1977: \item {\it RBSYM\/}: specifies that internal symmetry operations permuting equivalent sites for
1984: rigid-body building blocks exist. The operations are read in from a file {\tt rbsymops}, which must1978: rigid-body building blocks exist. The operations are read in from a file {\tt rbsymops}, which must
1985: exist in the working directory. The first line of the file is an integer that specifies the number1979: exist in the working directory. The first line of the file is an integer that specifies the number
1986: of operations generated by proper axes of rotation including the identity operation; the operations1980: of operations generated by proper axes of rotation including the identity operation; the operations


legend
Lines Added 
Lines changed
 Lines Removed

hdiff - version: 2.1.0