hdiff output

r32031/genrigid_input.py 2017-03-07 10:30:13.393626015 +0000 r32030/genrigid_input.py 2017-03-07 10:30:13.649629409 +0000
1886:                         prob, amp = get_prob_amb()1886:                         prob, amp = get_prob_amb()
1887:                     ax1 = loaded_mol.get_atom_id_from_name('CA', res_gr)1887:                     ax1 = loaded_mol.get_atom_id_from_name('CA', res_gr)
1888:                     ax2 = loaded_mol.get_atom_id_from_name('CB', res_gr)1888:                     ax2 = loaded_mol.get_atom_id_from_name('CB', res_gr)
1889:                     gr_name = 'CACB' + str(res_gr)1889:                     gr_name = 'CACB' + str(res_gr)
1890:                     gr_atoms = []1890:                     gr_atoms = []
1891:                     for gr_atom in loaded_mol.get_atom_list(res_gr):1891:                     for gr_atom in loaded_mol.get_atom_list(res_gr):
1892:                         if atom_dic[gr_atom][0] not in ['N', 'H', 'C', 'CA', 'HA', 'CB', 'O', 'OXT', 'H1', 'H2', 'H3']:1892:                         if atom_dic[gr_atom][0] not in ['N', 'H', 'C', 'CA', 'HA', 'CB', 'O', 'OXT', 'H1', 'H2', 'H3']:
1893:                             gr_atoms.append(gr_atom)1893:                             gr_atoms.append(gr_atom)
1894:                     grot_dic[len(grot_dic) + 1] = [gr_name, ax1, ax2, len(gr_atoms), amp, prob, gr_atoms]1894:                     grot_dic[len(grot_dic) + 1] = [gr_name, ax1, ax2, len(gr_atoms), amp, prob, gr_atoms]
1895: 1895: 
1896:                 if group_rotations[3] and gr_res_name not in ['PRO', 'ILE', 'ALA', 'GLY', 'SER', 'CYS', 'THR', 'VAL']:1896:                 if group_rotations[3] and gr_res_name not in ['PRO', 'ALA', 'GLY', 'SER', 'CYS', 'THR', 'VAL']:
1897:                     # CB-CG rotation1897:                     # CB-CG rotation
1898:                     if def_values[3]:1898:                     if def_values[3]:
1899:                         prob = prob_uni1899:                         prob = prob_uni
1900:                         try:1900:                         try:
1901:                             amp = amp_dic[gr_res_name][1]  # use default amplitude1901:                             amp = amp_dic[gr_res_name][1]  # use default amplitude
1902:                         except KeyError:1902:                         except KeyError:
1903:                             print 'No default data available for ' + gr_res_name1903:                             print 'No default data available for ' + gr_res_name
1904:                             prob, amp = get_prob_amb()1904:                             prob, amp = get_prob_amb()
1905:                     else:1905:                     else:
1906:                         prob, amp = get_prob_amb()1906:                         prob, amp = get_prob_amb()


legend
Lines Added 
Lines changed
 Lines Removed

hdiff - version: 2.1.0