hdiff output

r28170/perm-pdb.py 2016-07-06 15:37:11.768525447 +0100 r28169/perm-pdb.py 2016-07-06 15:37:12.112530067 +0100
 51:   def copy(this): 51:   def copy(this):
 52:     n = Atom() 52:     n = Atom()
 53:     n.name=this.name 53:     n.name=this.name
 54:     n.acidname=this.acidname 54:     n.acidname=this.acidname
 55:     n.atom=this.index 55:     n.atom=this.index
 56:     return n 56:     return n
 57:  57: 
 58: # This function reads and stores atom name, its corresponding residue name and its index 58: # This function reads and stores atom name, its corresponding residue name and its index
 59: def readatom(s): 59: def readatom(s):
 60:   a = Atom() 60:   a = Atom()
 61: # Reading from column 18 to 21 allows for 4 letter residue names e.g. termini 61:   a.acidname=s[17:20].strip()
 62: #  a.acidname=s[17:20].strip() 
 63:   a.acidname=s[17:21].strip() 
 64:   a.name = s[12:16].strip() 62:   a.name = s[12:16].strip()
 65:   a.index = s[6:11].strip() 63:   a.index = s[6:11].strip()
 66:   return a 64:   return a
 67:  65: 
 68: prev=0 66: prev=0
 69: finals=[] 67: finals=[]
 70: for each in inp: 68: for each in inp:
 71:   els = each.split() 69:   els = each.split()
 72:   if len(els)==1 and prev==0: continue 70:   if len(els)==1 and prev==0: continue
 73:   if (els[0]=='TER'): continue 71:   if (els[0]=='TER'): continue


legend
Lines Added 
Lines changed
 Lines Removed

hdiff - version: 2.1.0