hdiff output

r10142/config.h 2017-01-21 10:40:22.708237145 +0000 r10141/config.h 2017-01-21 10:40:23.888299347 +0000
  1: #  NAB configuration file, created with: ./configure -p4 gcc  1: #  NAB configuration file, created with: ./configure -p4 gcc
  2:   2: 
  3: ###############################################################################  3: ###############################################################################
  4:   4: 
  5: # (1)  You need to define the symbol NABHOME in your environment  5: # (1)  You need to define the symbol NABHOME in your environment
  6:   6: 
  7: #    NABHOME should be an absolute path to the top-level NAB directory;  7: #    NABHOME should be an absolute path to the top-level NAB directory;
  8: #    files are installed to the following directories:  8: #    files are installed to the following directories:
  9: NABHOME=/home/sf344/code/svn/NAB  9: #NABHOME=/home/sf344/code/svn/NAB
 10: BINDIR=$(NABHOME)/bin 10: BINDIR=$(NABHOME)/bin
 11: LIBDIR=$(NABHOME)/lib 11: LIBDIR=$(NABHOME)/lib
 12: INCDIR=$(NABHOME)/include 12: INCDIR=$(NABHOME)/include
 13:  13: 
 14: ############################################################################### 14: ###############################################################################
 15:  15: 
 16:  16: 
 17: #  (2) If you want to search additional libraries by default, add them 17: #  (2) If you want to search additional libraries by default, add them
 18: #      to the FLIBS variable here.  (External libraries can also be linked into 18: #      to the FLIBS variable here.  (External libraries can also be linked into
 19: #      NAB programs simply by including them on the command line; libraries 19: #      NAB programs simply by including them on the command line; libraries
 30:  30: 
 31: #  Set the C compiler, etc.  31: #  Set the C compiler, etc. 
 32:  32: 
 33: #          For GNU:  CC-->gcc; LEX-->flex; YACC-->bison -y -t; 33: #          For GNU:  CC-->gcc; LEX-->flex; YACC-->bison -y -t;
 34: #          Note: If your lexer is "really" flex, you need to set 34: #          Note: If your lexer is "really" flex, you need to set
 35: #          LEX=flex below.  For example, on many linux distributions, 35: #          LEX=flex below.  For example, on many linux distributions,
 36: #          /usr/bin/lex is really just a pointer to /usr/bin/flex, 36: #          /usr/bin/lex is really just a pointer to /usr/bin/flex,
 37: #          so LEX=flex is necessary.  In general, gcc seems to need 37: #          so LEX=flex is necessary.  In general, gcc seems to need
 38: #          flex. 38: #          flex.
 39:  39: 
 40: CC=gcc  40: CC=pgcc 
 41: ##CFLAGS=-march=pentium4  41: #CFLAGS=-march=pentium4 
 42: #CFLAGS=-O3 -Mnoframe -Mflushz -Munroll 42: CFLAGS=-O3 -Mnoframe -Mflushz -Munroll
 43: #OCFLAGS=-O3 -Mnoframe -Mflushz -Munroll 43: OCFLAGS=-O3 -Mnoframe -Mflushz -Munroll
 44:  44: 
 45: ##-Mprefetch=w -tp=amd64e   45: #-Mprefetch=w -tp=amd64e  
 46: ##CFLAGS=-O3 -Mprefetch=w -tp=amd64e 46: #CFLAGS=-O3 -Mprefetch=w -tp=amd64e
  47: NABFLAGS=
  48: #CFLAGS= -march=pentium4 
  49: #OCFLAGS=-O3 -march=pentium4  
 47: #NABFLAGS= 50: #NABFLAGS=
 48: ##CFLAGS= -march=pentium4  
 49: ##OCFLAGS=-O3 -march=pentium4   
 50: ##NABFLAGS= 
 51:  51: 
 52:  52: 
 53: LEX=    flex 53: LEX=    flex
 54: YACC=bison -y -t 54: YACC=bison -y -t
 55: #$(NABHOME)/byacc/yacc 55: #$(NABHOME)/byacc/yacc
 56: AR=     ar 56: AR=     ar
 57: RANLIB= ranlib 57: RANLIB= ranlib
 58:  58: 
 59: #  Set the C-preprocessor.  Code for a small preprocessor is in 59: #  Set the C-preprocessor.  Code for a small preprocessor is in
 60: #    uccp-1.3;  it gets installed as $(NABHOME)/bin/ucpp; 60: #    uccp-1.3;  it gets installed as $(NABHOME)/bin/ucpp;


r10142/getparams.f 2017-01-21 10:40:23.420274699 +0000 r10141/getparams.f 2017-01-21 10:40:24.560334632 +0000
160:             CLOSE(9)160:             CLOSE(9)
161:             GOTO 400161:             GOTO 400
162:          ENDIF162:          ENDIF
163:          NATOMS=NATOMS+1163:          NATOMS=NATOMS+1
164:          GOTO 310164:          GOTO 310
165:       ELSE IF (WORD.EQ.'AMBER9'.OR.(WORD.EQ.'NAB')) THEN165:       ELSE IF (WORD.EQ.'AMBER9'.OR.(WORD.EQ.'NAB')) THEN
166:          IF(WORD.EQ.'AMBER9') AMBERT=.TRUE.166:          IF(WORD.EQ.'AMBER9') AMBERT=.TRUE.
167:          IF(WORD.EQ.'NAB') NABT=.TRUE.167:          IF(WORD.EQ.'NAB') NABT=.TRUE.
168: !         NATOMS=0168: !         NATOMS=0
169:         inpcrd='coords.inpcrd'169:         inpcrd='coords.inpcrd'
170:        IF(NITEMS<3) then 
171:          call amberinterface(natoms,2,inpcrd,6)170:          call amberinterface(natoms,2,inpcrd,6)
 171:        IF(NITEMS<3) then
172:          CALL READA(amberstr)172:          CALL READA(amberstr)
173:           IF (FILTH2.NE.0) THEN173:           IF (FILTH2.NE.0) THEN
174:             WRITE(OTEMP,*) FILTH2174:             WRITE(OTEMP,*) FILTH2
175:             write(ostring,'(A)') trim(adjustl(amberstr))//'.'//trim(adjustl(otemp))175:             write(ostring,'(A)') trim(adjustl(amberstr))//'.'//trim(adjustl(otemp))
176:             WRITE(*,*) 'ostring=', ostring176:             WRITE(*,*) 'ostring=', ostring
177:           ELSE177:           ELSE
178:             write(ostring,'(A)') trim(adjustl(amberstr))178:             write(ostring,'(A)') trim(adjustl(amberstr))
179:           END IF179:           END IF
180:           WRITE(*,'(A)') ' getparams> input coordinates for AMBER9 system will be read from ',trim(adjustl(amberstr)),ostring180:           WRITE(*,'(A)') ' getparams> input coordinates for AMBER9 system will be read from ',trim(adjustl(amberstr)),ostring
181:          CALL amber_readcoords(ostring)181:          CALL amber_readcoords(ostring)


legend
Lines Added 
Lines changed
 Lines Removed

hdiff - version: 2.1.0