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r33320/commons.f90 2017-09-18 10:30:11.586695951 +0100 r33319/commons.f90 2017-09-18 10:30:12.722711196 +0100
 35:      &        GCINT, GCRELAX, MTARGETS, & 35:      &        GCINT, GCRELAX, MTARGETS, &
 36:      &        INTCONSEP, INTREPSEP, NCONSTRAINTON, CPREPSEP, CPCONSEP, NCONGEOM, & 36:      &        INTCONSEP, INTREPSEP, NCONSTRAINTON, CPREPSEP, CPCONSEP, NCONGEOM, &
 37:      &        NCPREPULSIVE, NCPCONSTRAINT, MAXCONUSE, INTCONSTEPS, INTRELSTEPS, INTSTEPS1, INTLJSTEPS, & 37:      &        NCPREPULSIVE, NCPCONSTRAINT, MAXCONUSE, INTCONSTEPS, INTRELSTEPS, INTSTEPS1, INTLJSTEPS, &
 38:      &        NTRAPPOW, MAXINTIMAGE, CHECKREPINTERVAL, INTFREEZEMIN, INTNTRIESMAX, INTIMAGEINCR, & 38:      &        NTRAPPOW, MAXINTIMAGE, CHECKREPINTERVAL, INTFREEZEMIN, INTNTRIESMAX, INTIMAGEINCR, &
 39:      &        NCONSTRAINTFIX, INTIMAGECHECK, NREPULSIVEFIX, INTIMAGE, NREPULSIVE, & 39:      &        NCONSTRAINTFIX, INTIMAGECHECK, NREPULSIVEFIX, INTIMAGE, NREPULSIVE, &
 40:      &        NNREPULSIVE, NCONSTRAINT, INTMUPDATE, DUMPINTEOSFREQ, DUMPINTXYZFREQ, & 40:      &        NNREPULSIVE, NCONSTRAINT, INTMUPDATE, DUMPINTEOSFREQ, DUMPINTXYZFREQ, &
 41:      &        LOCALPERMNEIGH, LOCALPERMMAXSEP, MAXNACTIVE, QCIPERMCHECKINT, & 41:      &        LOCALPERMNEIGH, LOCALPERMMAXSEP, MAXNACTIVE, QCIPERMCHECKINT, &
 42:      &        MLPIN, MLPSTART, MLPOUT, MLPHIDDEN, MLPDATA, NMLP, DJWRBID, NHEXAMERS, QCIADDREP, QCIBONDS, QCISECOND, MQUNIT, & 42:      &        MLPIN, MLPSTART, MLPOUT, MLPHIDDEN, MLPDATA, NMLP, DJWRBID, NHEXAMERS, QCIADDREP, QCIBONDS, QCISECOND, MQUNIT, &
 43:      &        MLQIN, MLQSTART, MLQOUT, MLQDATA, NMLQ, NADDTARGET, NUMNN, SQNM_HISTMAX, SQNM_DEBUGRUN, SQNM_DEBUGLEVEL, & 43:      &        MLQIN, MLQSTART, MLQOUT, MLQDATA, NMLQ, NADDTARGET, NUMNN, SQNM_HISTMAX, SQNM_DEBUGRUN, SQNM_DEBUGLEVEL, &
 44:      &        SQNM_WRITEMAX, NEWALDREAL(3), NEWALDRECIP(3), EWALDN, MLPNEIGH, BOXSTEPFREQ, NDISPLACEMENTS, NROTATIONS, MAX_ANGMOM, & 44:      &        SQNM_WRITEMAX, NEWALDREAL(3), NEWALDRECIP(3), EWALDN, MLPNEIGH, BOXSTEPFREQ, NDISPLACEMENTS, NROTATIONS, MAX_ANGMOM, &
 45:      &        BNB_NSTEPS, QUIPZ 45:      &        BNB_NSTEPS
 46:  46: 
 47:       DOUBLE PRECISION RHO, GAMMA, SIG, SCEPS, SCC, TOLB, T12FAC, XMOVERENORM, RESIZE, QTSALLIS, & 47:       DOUBLE PRECISION RHO, GAMMA, SIG, SCEPS, SCC, TOLB, T12FAC, XMOVERENORM, RESIZE, QTSALLIS, &
 48:      &                 CQMAX, RADIUS, BQMAX,  MAXBFGS, DECAYPARAM, SYMTOL1, SYMTOL2, SYMTOL3, SYMTOL4, SYMTOL5, PGSYMTOLS(3),& 48:      &                 CQMAX, RADIUS, BQMAX,  MAXBFGS, DECAYPARAM, SYMTOL1, SYMTOL2, SYMTOL3, SYMTOL4, SYMTOL5, PGSYMTOLS(3),&
 49:      &                 ECONV, TOLD, TOLE, SYMREM(120,3,3), GMAX, CUTOFF, PCUT, EXPFAC, EXPD, CENTX, CENTY, CENTZ, & 49:      &                 ECONV, TOLD, TOLE, SYMREM(120,3,3), GMAX, CUTOFF, PCUT, EXPFAC, EXPD, CENTX, CENTY, CENTZ, &
 50:      &                 BOXLX, BOXLY, BOXLZ, BOX3D(3), PCUTOFF, SUPSTEP, SQUEEZER, SQUEEZED, COOPCUT, STOCKMU, STOCKLAMBDA, & 50:      &                 BOXLX, BOXLY, BOXLZ, BOX3D(3), PCUTOFF, SUPSTEP, SQUEEZER, SQUEEZED, COOPCUT, STOCKMU, STOCKLAMBDA, &
 51:      &                 TFAC(3), RMS, TEMPS, SACCRAT, CEIG, PNEWJUMP, EAMP, DISTFAC, ODDCHARGE, COULQ, COULSWAP, & 51:      &                 TFAC(3), RMS, TEMPS, SACCRAT, CEIG, PNEWJUMP, EAMP, DISTFAC, ODDCHARGE, COULQ, COULSWAP, &
 52:      &                 COULTEMP, APP, AMM, APM, XQP, XQM, ALPHAP, ALPHAM, ZSTAR, K_COMP, DGUESS, GUIDECUT, EFAC,& 52:      &                 COULTEMP, APP, AMM, APM, XQP, XQM, ALPHAP, ALPHAM, ZSTAR, K_COMP, DGUESS, GUIDECUT, EFAC,&
 53:      &                 TRENORM, HISTMIN, HISTMAX, HISTFAC, EPSSPHERE, FINALCUTOFF, SHELLPROB, RINGROTSCALE, & 53:      &                 TRENORM, HISTMIN, HISTMAX, HISTFAC, EPSSPHERE, FINALCUTOFF, SHELLPROB, RINGROTSCALE, &
 54:      &                 HISTFACMUL, HPERCENT, AVOIDDIST, MAXERISE, MAXEFALL, TSTART, MATDIFF, STICKYSIG, SDTOL, & 54:      &                 HISTFACMUL, HPERCENT, AVOIDDIST, MAXERISE, MAXEFALL, TSTART, MATDIFF, STICKYSIG, SDTOL, &
 55:      &                 MinimalTemperature, MaximalTemperature, SwapProb, hdistconstraint, COREFRAC, TSTAR, & 55:      &                 MinimalTemperature, MaximalTemperature, SwapProb, hdistconstraint, COREFRAC, TSTAR, &
 81:      &                 MSTART,MFINISH,MBSTART1,MBFINISH1,MBSTART2,MBFINISH2,MBHEIGHT1,MBHEIGHT2,ME1,ME2,ME3, & 81:      &                 MSTART,MFINISH,MBSTART1,MBFINISH1,MBSTART2,MBFINISH2,MBHEIGHT1,MBHEIGHT2,ME1,ME2,ME3, &
 82:      &                 BSPTQMAX, BSPTQMIN, PFORCE, CSMNORM, CSMGUIDENORM, CSMEPS, PERCCUT, PERCGROUPCUT, & 82:      &                 BSPTQMAX, BSPTQMIN, PFORCE, CSMNORM, CSMGUIDENORM, CSMEPS, PERCCUT, PERCGROUPCUT, &
 83:      &                 LOWESTE, PERTSTEP, GCPLUS, & 83:      &                 LOWESTE, PERTSTEP, GCPLUS, &
 84:      &                 KINT, INTFREEZETOL, IMSEPMIN, IMSEPMAX, CONCUTABS, CONCUTFRAC, & 84:      &                 KINT, INTFREEZETOL, IMSEPMIN, IMSEPMAX, CONCUTABS, CONCUTFRAC, &
 85:      &                 LPDGEOMDIFFTOL, INTCONFRAC, MAXCONE, INTRMSTOL, BFGSTSTOL, ORBITTOL, & 85:      &                 LPDGEOMDIFFTOL, INTCONFRAC, MAXCONE, INTRMSTOL, BFGSTSTOL, ORBITTOL, &
 86:      &                 INTCONSTRAINTTOL, INTCONSTRAINTDEL, RBCUTOFF, INTCONSTRAINTREP, INTCONSTRAINREPCUT, & 86:      &                 INTCONSTRAINTTOL, INTCONSTRAINTDEL, RBCUTOFF, INTCONSTRAINTREP, INTCONSTRAINREPCUT, &
 87:      &                 INTLJTOL, INTLJDEL, INTLJEPS, REPCON, INTDGUESS, CHECKREPCUTOFF, INTMINFAC, FREEZETOL, & 87:      &                 INTLJTOL, INTLJDEL, INTLJEPS, REPCON, INTDGUESS, CHECKREPCUTOFF, INTMINFAC, FREEZETOL, &
 88:      &                 LOCALPERMCUT, LOCALPERMCUT2, INTCONCUT, QCIRADSHIFT, MLPLAMBDA, & 88:      &                 LOCALPERMCUT, LOCALPERMCUT2, INTCONCUT, QCIRADSHIFT, MLPLAMBDA, &
 89:      &                 CAPSIDRHO,CAPSIDEPS,SIGMAPENT,RADPENT,SIGMAHEX,RADHEX,SIGMAPH, KLIM, SCA, & 89:      &                 CAPSIDRHO,CAPSIDEPS,SIGMAPENT,RADPENT,SIGMAHEX,RADHEX,SIGMAPH, KLIM, SCA, &
 90:      &                 QCIADDREPCUT, QCIADDREPEPS, MLQLAMBDA, TANHFAC, LJADDCUTOFF,LJADDREFNORM, & 90:      &                 QCIADDREPCUT, QCIADDREPEPS, MLQLAMBDA, TANHFAC, LJADDCUTOFF,LJADDREFNORM, &
 91:      &                 ALPHAATT, NNCUTOFF, BOX_PARAMS(6), BOX_PARAMSGRAD(6), BOX_PARAMSO(6), QUIPLATT(3,3) 91:      &                 ALPHAATT, NNCUTOFF, BOX_PARAMS(6), BOX_PARAMSGRAD(6), BOX_PARAMSO(6)
 92:  92: 
 93:       LOGICAL DEBUG, TARGET, MORSET, CUTT, SEEDT, CENT, TSALLIST, FREEZECORE, NEWJUMP, RENORM, CAPSID, FREEZE, & 93:       LOGICAL DEBUG, TARGET, MORSET, CUTT, SEEDT, CENT, TSALLIST, FREEZECORE, NEWJUMP, RENORM, CAPSID, FREEZE, &
 94:      &        OTPT, LJMFT, STRANDT, PAHT, SWT, MSTRANST, STOCKT, STICKYT, BLNT, MYSDT, FREEZERES, CENTXY, & 94:      &        OTPT, LJMFT, STRANDT, PAHT, SWT, MSTRANST, STOCKT, STICKYT, BLNT, MYSDT, FREEZERES, CENTXY, &
 95:      &        MSORIGT, SQUEEZET, PERIODIC, SCT, MSCT, MGUPTAT, RESIZET, TIP, RIGID, CALCQT, MPIT, GBHT, JMT, LJCOULT, LJ_GAUSST, OPPT, SETCENT, & 95:      &        MSORIGT, SQUEEZET, PERIODIC, SCT, MSCT, MGUPTAT, RESIZET, TIP, RIGID, CALCQT, MPIT, GBHT, JMT, LJCOULT, LJ_GAUSST, OPPT, SETCENT, &
 96:      &        SORTT, HIT, SAVEQ, PARALLELT, FIXD, RKMIN, BSMIN, PERMDIST, PERMOPT, BSWL, BSPT, BSPTRESTART, & 96:      &        SORTT, HIT, SAVEQ, PARALLELT, FIXD, RKMIN, BSMIN, PERMDIST, PERMOPT, BSWL, BSPT, BSPTRESTART, &
 97:      &        SYMMETRIZE, SYMMETRIZECSM, PRINT_PTGRP, PRINT_MINDATA, DUMPT, NEON, ARGON, P46, NORESET, TABOOT, EVSTEPT, PACHECO, DL_POLY, QUCENTRE, & 97:      &        SYMMETRIZE, SYMMETRIZECSM, PRINT_PTGRP, PRINT_MINDATA, DUMPT, NEON, ARGON, P46, NORESET, TABOOT, EVSTEPT, PACHECO, DL_POLY, QUCENTRE, &
 98:      &        STAR, PLUS, TWOPLUS, GROUND, DIPOLE, DFTBT, DFTBCT, SW, SUPERSTEP, EAMLJT, PBGLUET, TRACKDATAT, & 98:      &        STAR, PLUS, TWOPLUS, GROUND, DIPOLE, DFTBT, DFTBCT, SW, SUPERSTEP, EAMLJT, PBGLUET, TRACKDATAT, &
 99:      &        EAMALT, ALGLUET, MGGLUET, GUPTAT, LJATT, FST, DECAY, COOP, FIXBIN, GAUSST, QUENCHDOS, FIXDIHEFLAG, & 99:      &        EAMALT, ALGLUET, MGGLUET, GUPTAT, LJATT, FST, DECAY, COOP, FIXBIN, GAUSST, QUENCHDOS, FIXDIHEFLAG, &
100:      &        FRAUSIT, ANGST, SELFT, STEPOUT, WENZEL, THRESHOLDT, THOMSONT, MULLERBROWNT, CHARMMENERGIES, &100:      &        FRAUSIT, ANGST, SELFT, STEPOUT, WENZEL, THRESHOLDT, THOMSONT, MULLERBROWNT, CHARMMENERGIES, &
101:      &        PROJ, RGCL2, TOSI, WELCH, AXTELL, AMBER, FIXIMAGE, BINARY, SHIFTCUT, ARNO, TUNNELT, TWOD, &101:      &        PROJ, RGCL2, TOSI, WELCH, AXTELL, AMBER, FIXIMAGE, BINARY, SHIFTCUT, ARNO, TUNNELT, TWOD, &


r33320/potential.f90 2017-09-18 10:30:11.814698955 +0100 r33319/potential.f90 2017-09-18 10:30:12.982714324 +0100
1057:          CSMGP=CSMGPSAVE1057:          CSMGP=CSMGPSAVE
1058:          CSMGPINDEX=CSMGPINDEXSAVE1058:          CSMGPINDEX=CSMGPINDEXSAVE
1059:          PTGP(1:3, 1:3, 1:2*CSMGPINDEX)=PTGPSAVE(1:3, 1:3, 1:2*CSMGPINDEX)1059:          PTGP(1:3, 1:3, 1:2*CSMGPINDEX)=PTGPSAVE(1:3, 1:3, 1:2*CSMGPINDEX)
1060:          CSMNORM=CSMNORMSAVE1060:          CSMNORM=CSMNORMSAVE
1061:       END IF1061:       END IF
1062: 1062: 
1063:    ELSE IF (PERMOPT .OR. PERMINVOPT .OR. DISTOPT .OR. ALIGNT) THEN1063:    ELSE IF (PERMOPT .OR. PERMINVOPT .OR. DISTOPT .OR. ALIGNT) THEN
1064: !  EREAL is the distance in this case1064: !  EREAL is the distance in this case
1065:       write(*,*) "Calling ALIGN_DECIDE from POTENTIAL, PERIODIC=",PERIODIC1065:       write(*,*) "Calling ALIGN_DECIDE from POTENTIAL, PERIODIC=",PERIODIC
1066:       CALL ALIGN_DECIDE(FIN, X, NATOMS, DEBUG, BOXLX, BOXLY, BOXLZ, PERIODIC, TWOD, EREAL, DIST2, RIGID, RMAT)1066:       CALL ALIGN_DECIDE(FIN, X, NATOMS, DEBUG, BOXLX, BOXLY, BOXLZ, PERIODIC, TWOD, EREAL, DIST2, RIGID, RMAT)
1067: !     IF (DEBUG) THEN 1067:       IF(DEBUG) THEN 
1068: !       WRITE(MYUNIT,'(A)') 'Rotation matrix:'1068:         WRITE(MYUNIT,'(A)') 'Rotation matrix:'
1069: !       WRITE(MYUNIT,*) RMAT(:,:)1069:         WRITE(MYUNIT,*) RMAT(:,:)
1070: !     ENDIF1070:       END IF
1071: 1071: 
1072:    ELSE IF (MKTRAPT) THEN1072:    ELSE IF (MKTRAPT) THEN
1073:       CALL MKTRAP(NATOMS, X, GRAD, EREAL)1073:       CALL MKTRAP(NATOMS, X, GRAD, EREAL)
1074:    ELSE IF (BLJCLUSTER) THEN1074:    ELSE IF (BLJCLUSTER) THEN
1075:       CALL RAD(X, GRAD, EREAL, GRADT)1075:       CALL RAD(X, GRAD, EREAL, GRADT)
1076:       CALL LJPSHIFTBINC(X, GRAD, EREAL, GRADT, SECT)1076:       CALL LJPSHIFTBINC(X, GRAD, EREAL, GRADT, SECT)
1077: 1077: 
1078:    ELSE IF (BLJCLUSTER_NOCUT) THEN1078:    ELSE IF (BLJCLUSTER_NOCUT) THEN
1079: ! ds656> Binary LJ without cutoff1079: ! ds656> Binary LJ without cutoff
1080:       CALL RAD(X, GRAD, EREAL, GRADT)1080:       CALL RAD(X, GRAD, EREAL, GRADT)


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