hdiff output

r31432/OPTIM.tex 2017-01-21 10:42:09.708934245 +0000 r31431/OPTIM.tex 2017-01-21 10:42:09.952943070 +0000
765: If the string {\it NOINDEX\/} is present then the Hessian index isn't checked.765: If the string {\it NOINDEX\/} is present then the Hessian index isn't checked.
766: 766: 
767: \item {\it COPYRIGHT\/}: prints copyright information.767: \item {\it COPYRIGHT\/}: prints copyright information.
768: 768: 
769: \item {\it CPMD system\/}: tells the program to use CPMD to calculate energies and769: \item {\it CPMD system\/}: tells the program to use CPMD to calculate energies and
770: forces with input file {\it system\/}; bulk boundary conditions.770: forces with input file {\it system\/}; bulk boundary conditions.
771: 771: 
772: \item {\it CPMDC system\/}: tells the program to use CPMD to calculate energies and772: \item {\it CPMDC system\/}: tells the program to use CPMD to calculate energies and
773: forces with input file {\it system\/}; cluster boundary conditions.773: forces with input file {\it system\/}; cluster boundary conditions.
774: 774: 
775: \item {\it CPPNEB\/}: specifies that the C++ implementation of the DNEB algorithm should be used. For this keyword to work, you must first download the C++ source code into OPTIM/cppneb/external (running the script OPTIM/source/setup.sh does this automatically). You must also compile OPTIM with the WITH_CPPNEB option set, and then use the executable OPTIM_CPPNEB. NOTE: the C++ code expects that the variable NEBK will be set to the value of half the actual spring constant. If you are translating between the Fortran and C++ implementations of DNEB, you will need to adjust your NEBK accordingly. 
776:  
777: \item {\it CUBIC\/}: if the three box lengths are equal to start with in a {\it PV\/} run,775: \item {\it CUBIC\/}: if the three box lengths are equal to start with in a {\it PV\/} run,
778: and the keyword {\it CUBIC \/} is included, then a cubic box is maintained. 776: and the keyword {\it CUBIC \/} is included, then a cubic box is maintained. 
779: 777: 
780: \item {\it CUBSPL\/}: For the growing string or evolving string double-ended778: \item {\it CUBSPL\/}: For the growing string or evolving string double-ended
781:   transition state search methods, use a cubic spline interpolation between779:   transition state search methods, use a cubic spline interpolation between
782:   the image points.780:   the image points.
783: 781: 
784: \item {\it CUDA potential\/}: specifies a GPU run. Setting {\it potential} to 'A' specifies the AMBER12 potential. See the group wiki for further information.782: \item {\it CUDA potential\/}: specifies a GPU run. Setting {\it potential} to 'A' specifies the AMBER12 potential. See the group wiki for further information.
785: 783: 
786: \item {\it CUTOFF rcut\/}: Specify that the potential should go be zero for784: \item {\it CUTOFF rcut\/}: Specify that the potential should go be zero for


legend
Lines Added 
Lines changed
 Lines Removed

hdiff - version: 2.1.0