hdiff output

r28668/OPTIM.tex 2015-11-17 23:37:07.963829983 +0000 r28667/OPTIM.tex 2015-11-17 23:37:08.167832718 +0000
598: \item {\it CHARMM\/}: specifies that the CHARMM potential is used. An auxiliary file 598: \item {\it CHARMM\/}: specifies that the CHARMM potential is used. An auxiliary file 
599: {\tt input.crd} is required. {\it CHARMM} must be the last OPTIM directive in the 599: {\tt input.crd} is required. {\it CHARMM} must be the last OPTIM directive in the 
600: {\tt odata} file. The remaining content of {\tt odata} consists of CHARMM keywords and600: {\tt odata} file. The remaining content of {\tt odata} consists of CHARMM keywords and
601: setup information.601: setup information.
602: 602: 
603: \item {\it CHARMMDFTB\/}: specifies that the CHARMM SCC-DFTB potential is to be used, and 603: \item {\it CHARMMDFTB\/}: specifies that the CHARMM SCC-DFTB potential is to be used, and 
604: disables updates of the nonbonded list. This assumes you are using a fully QM system. If you604: disables updates of the nonbonded list. This assumes you are using a fully QM system. If you
605: are using a QM/MM setup, you should not use this keyword! Note that SCC-DFTB can only be used 605: are using a QM/MM setup, you should not use this keyword! Note that SCC-DFTB can only be used 
606: with CHARMM35.  606: with CHARMM35.  
607: 607: 
608: \item {\it CHARMMNOTUPDATE\/}: When using a very large cutoff, turn off nonbond list updating entirely. 
609:  
610: \item {\it CHARMMTYPE topfile paramfile\/}:  {\it topfile} and {\it paramfile} are the 608: \item {\it CHARMMTYPE topfile paramfile\/}:  {\it topfile} and {\it paramfile} are the 
611: common CHARMM top and param files , e.g., `toph19\_eef1\_perm.inp' and `param19\_eef1\_perm.inp'.609: common CHARMM top and param files , e.g., `toph19\_eef1\_perm.inp' and `param19\_eef1\_perm.inp'.
612: 610: 
613: \item {\it CHDEBUG EDEBUG\/}: produces more CHARMM related printing. Turned off by default.611: \item {\it CHDEBUG EDEBUG\/}: produces more CHARMM related printing. Turned off by default.
614: If EDEBUG is given as argument, after each CHARMM energy call the energy is decomposed612: If EDEBUG is given as argument, after each CHARMM energy call the energy is decomposed
615: and the components printed. Produces a lot of output!613: and the components printed. Produces a lot of output!
616: 614: 
617: \item {\it CHECKINDEX nevs ceig nevl\/}: instructs the program to check the Hessian615: \item {\it CHECKINDEX nevs ceig nevl\/}: instructs the program to check the Hessian
618: index after a BFGS minimisation or BFGS hybrid transition616: index after a BFGS minimisation or BFGS hybrid transition
619: state search. This keyword also works with {\it NOHESS\/}.617: state search. This keyword also works with {\it NOHESS\/}.


legend
Lines Added 
Lines changed
 Lines Removed

hdiff - version: 2.1.0