hdiff output

r26742/CMakeLists.txt 2017-01-21 10:34:21.282250000 +0000 r26741/CMakeLists.txt 2017-01-21 10:34:22.242250000 +0000
  1: svn: E195012: Unable to find repository location for 'svn+ssh://svn.ch.private.cam.ac.uk/groups/wales/trunk/GMIN/source/CHARMMboth/CMakeLists.txt' in revision 26742  1: svn: E195012: Unable to find repository location for 'svn+ssh://svn.ch.private.cam.ac.uk/groups/wales/trunk/GMIN/source/CHARMMboth/CMakeLists.txt' in revision 26741


r26742/FindCHARMM35.cmake 2017-01-21 10:34:20.962250000 +0000 r26741/FindCHARMM35.cmake 2017-01-21 10:34:21.930250000 +0000
 20:   if(COMPILER_SWITCH MATCHES "pgi") 20:   if(COMPILER_SWITCH MATCHES "pgi")
 21:     set(CHARMM_COMPILE_ARGS gnu medium keepo keepf PGF90 OPT CACHE TYPE STRING) 21:     set(CHARMM_COMPILE_ARGS gnu medium keepo keepf PGF90 OPT CACHE TYPE STRING)
 22:   elseif(COMPILER_SWITCH MATCHES "ifort") 22:   elseif(COMPILER_SWITCH MATCHES "ifort")
 23:     set(CHARMM_COMPILE_ARGS gnu medium keepo keepf IFORT OPT CACHE TYPE STRING) 23:     set(CHARMM_COMPILE_ARGS gnu medium keepo keepf IFORT OPT CACHE TYPE STRING)
 24:   endif(COMPILER_SWITCH MATCHES "pgi") 24:   endif(COMPILER_SWITCH MATCHES "pgi")
 25:  25: 
 26: message("${SVN_ROOT}/CMakeModules/FindCHARMM35.cmake: compiling CHARMM35 with arguments = ${CHARMM_COMPILE_ARGS}")                       26: message("${SVN_ROOT}/CMakeModules/FindCHARMM35.cmake: compiling CHARMM35 with arguments = ${CHARMM_COMPILE_ARGS}")                      
 27: message("charmm libs = ${CHARMM_LIBS}") 27: message("charmm libs = ${CHARMM_LIBS}")
 28:  28: 
 29: add_custom_command( 29: add_custom_command(
 30:    OUTPUT CHARMM_WAS_BUILT 30:    OUTPUT CHARMM_WAS_BUILD
 31:    COMMAND ./clean.csh 31:    COMMAND ./clean.csh
 32:    COMMAND ./install.com ${CHARMM_COMPILE_ARGS} > build.log 32:    COMMAND ./install.com ${CHARMM_COMPILE_ARGS} > build.log
 33:    COMMAND touch ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/CHARMM_WAS_BUILT 33:    COMMAND touch ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/CHARMM_WAS_BUILD
 34:    WORKING_DIRECTORY ${SVN_ROOT}/CHARMM35 34:    WORKING_DIRECTORY ${SVN_ROOT}/CHARMM35
 35: ) 35: )
 36: #endif(DEFINED CHARMM_COMPILE_ARGS) 36: #endif(DEFINED CHARMM_COMPILE_ARGS)


r26742/install.com 2017-01-21 10:34:20.674250000 +0000 r26741/install.com 2017-01-21 10:34:21.642250000 +0000
2316:               /bin/mv $chmbuild/objlibs.mk_$$ $chmbuild/objlibs.mk2316:               /bin/mv $chmbuild/objlibs.mk_$$ $chmbuild/objlibs.mk
2317: else2317: else
2318:    set prate = ''2318:    set prate = ''
2319: endif2319: endif
2320: #2320: #
2321: 2321: 
2322: if ( ! $?MAKE_COMMAND ) then2322: if ( ! $?MAKE_COMMAND ) then
2323:   setenv MAKE_COMMAND make2323:   setenv MAKE_COMMAND make
2324: endif2324: endif
2325: 2325: 
2326: set go_make = "$MAKE_COMMAND -j1 -f Makefile -f charmm.mk -f adumb.mk -f cadint.mk"2326: set go_make = "$MAKE_COMMAND -f Makefile -f charmm.mk -f adumb.mk -f cadint.mk"
2327: set go_make = "$go_make -f cff.mk -f cheq.mk -f correl.mk -f dimb.mk -f dynamc.mk"2327: set go_make = "$go_make -f cff.mk -f cheq.mk -f correl.mk -f dimb.mk -f dynamc.mk"
2328: set go_make = "$go_make -f energy.mk -f gamint.mk -f gukint.mk"2328: set go_make = "$go_make -f energy.mk -f gamint.mk -f gukint.mk"
2329: set go_make = "$go_make -f gener.mk -f image.mk -f io.mk -f machdep.mk "2329: set go_make = "$go_make -f gener.mk -f image.mk -f io.mk -f machdep.mk "
2330: set go_make = "$go_make -f mc.mk -f mmff.mk -f manip.mk -f minmiz.mk"2330: set go_make = "$go_make -f mc.mk -f mmff.mk -f manip.mk -f minmiz.mk"
2331: set go_make = "$go_make -f misc.mk -f mndint.mk -f molvib.mk -f mscale.mk"2331: set go_make = "$go_make -f misc.mk -f mndint.mk -f molvib.mk -f mscale.mk"
2332: set go_make = "$go_make -f nbonds.mk -f pert.mk -f quantum.mk -f rxncor.mk"2332: set go_make = "$go_make -f nbonds.mk -f pert.mk -f quantum.mk -f rxncor.mk"
2333: set go_make = "$go_make -f shapes.mk -f solvation.mk -f util.mk "2333: set go_make = "$go_make -f shapes.mk -f solvation.mk -f util.mk "
2334: set go_make = "$go_make -f vibran.mk -f zerom.mk"2334: set go_make = "$go_make -f vibran.mk -f zerom.mk"
2335: 2335: 
2336: set go_make = "$go_make $cadpac $emapmk $flucq $gamess $graphics $mbond"2336: set go_make = "$go_make $cadpac $emapmk $flucq $gamess $graphics $mbond"


legend
Lines Added 
Lines changed
 Lines Removed

hdiff - version: 2.1.0